PCR實驗室建設所(suǒ)需資料
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1周前
4月26日,國家衛健委舉辦全國視頻會議,明確提(tí)出(chū)“所有縣區級(jí)以上疾控機構、二級以上綜合(hé)醫院要抓(zhuā)緊進行改造,在短時(shí)間內形(xíng)成核酸檢測能力”。
各地的公立機構檢測能力不能滿足(zú)需求隻是暫(zàn)時的,獨立醫學實驗室在充實檢測力量的同時,發揮自己豐富的檢驗管理運營理念,以及區域(yù)化覆(fù)蓋的經驗優勢,融入到“國家隊”核酸檢測能力的建(jiàn)設中,順勢而為,乘勢而上。
隨著各地都在建立PCR實驗(yàn)室,本文從硬件基礎的角度,梳理了PCR實驗室建(jiàn)設(shè)的幾個關鍵點,獨(dú)立醫學實驗室可以運用(yòng)豐富的(de)運營經驗(yàn),進行(háng)建設指導、人員(yuán)梯隊建立、質(zhì)控體係搭(dā)建、區域化服務支持等。
如何建設PCR實驗室
與PCR實驗室建設相關的指導文件主要有四份(fèn):
《醫療機構管理(lǐ)條例》
《醫療機構臨床實驗室管理(lǐ)辦法》
《臨床基因擴(kuò)增檢(jiǎn)驗(yàn)實驗(yàn)室(shì)管理暫行辦法》
《醫療機構臨床基因擴增實驗(yàn)室管理辦法》
要求(qiú)臨床PCR實驗室(shì),不但在實驗(yàn)室設置及儀器設備等硬件上(shàng)要滿足開展臨床檢(jiǎn)驗(yàn)的條件,而且要(yào)求實驗室在日常工作要有文件化的工作程序。
下麵就在PCR實驗室建設過程中的幾(jǐ)個關鍵控(kòng)製點進行(háng)闡述:
01
建立PCR實驗室質量管理體係
根據實驗室的具(jù)體情況編寫質量體係(xì)文件,《質(zhì)量手冊》、《程序文件》、《作業指導書》,並保證管理體係運行有效。
管理(lǐ)體(tǐ)係的特點是應有明確的目的、規範的管(guǎn)理、有效的(de)製約、高效的機製(zhì)、能自我發展(zhǎn)的整體。
建立完善的SOP文件,對完成各(gè)項質量活動的方法作出規定,每個SOP都應對(duì)一個或一組相互(hù)關係的活動進行描述。
每個SOP文件應說明該項質量各環(huán)節(jiē)的輸入、轉換和輸出所需的文件、物資、人員、記錄以及它們與有關活動的接口關係。
明確每個環節轉換過程中各(gè)項因素(sù)的要求,即由誰做、做什麽(me)、做到什麽程序、達到什麽(me)要求,如何控製、形成什(shí)麽(me)記錄和報告,以及相應的審批手(shǒu)續。
規定在質量活動中需要注意(yì)的例外或特殊情況的糾正措施。SOP應簡(jiǎn)練、明確和易懂(dǒng)並且工作人員(yuán)熟練掌握和嚴格遵守。
02
PCR實驗室的相關設置
要完成一組PCR實驗,通常需要經過試(shì)劑配製、樣品處理、核酸擴增和產物分析(xī)4個實驗過程。
這4個實驗過程的實驗用房應相鄰布置,組成一個(gè)獨立的PCR實驗區。標準的PCR實驗區包括:試劑準備區、標本製備區、擴(kuò)增區、產物分析區、各區配套的緩衝區及公共走廊。
PCR實(shí)驗室整體平麵布局
某醫院PCR實驗室平麵布局如(rú)圖1所示,整個區域有一個公用走廊,每個獨立實驗區設有(yǒu)專(zhuān)門的緩衝區。通過壓差控(kòng)製,使整個PCR實驗過程中試(shì)劑和標本免(miǎn)受氣溶膠的汙染,並且降低擴增產(chǎn)物對人員和環境的汙染(rǎn)。
圖表1、某醫院PCR實驗室平麵(miàn)圖
試劑準備區(qū)
該實驗區主要進行的操作為貯存試劑的製備、試劑的分(fèn)裝和主反(fǎn)應混合液的製備。
試劑和(hé)用於標本製作的材料應直(zhí)接運送至該區,不得(dé)經過其他區域(yù)。試劑原材料必須貯存(cún)在(zài)本區內,並在本區內(nèi)製備成所需的貯存試(shì)劑。
試劑準備區配備有(yǒu)2~8°C冰箱和-80°C冰箱,計算冷負荷時,需要(yào)將它們計算在內。
房間的麵積宜控製在15m2~20m2。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對正壓狀態,以防止外界含核酸(suān)氣溶膠的空氣進入,造成汙染。
標本製備區
該區域主要進(jìn)行(háng)的操作為臨床標(biāo)本的保存、核酸(RNA、DNA)提取(qǔ)、貯存及其加入至擴(kuò)增反應管和測定RNA時cDNA的合成。
標本製備區配備有2~8°C冰箱和-20°C冰箱,計算冷負荷時,需要將它們計(jì)算在(zài)內。在標本製備區,還需要配備生物安全櫃,用於進行提取核酸的操作。
為避免提取的核酸在櫃(guì)內反複(fù)循環,造成標本之間的交(jiāo)叉汙染,出現假陽性結果,該區(qū)域配備的生物安全櫃必須是B2型的。生物安全櫃工作區垂直氣流全部來自實驗室,排風經過高效過濾器(www.gdlingjie.net)過濾後直接排至室外,不允許回到安全櫃和實驗室中。
根據經驗,如(rú)果實驗室內配備生物安全櫃,每(měi)配備一(yī)台,實(shí)驗室的麵積增加10m2;標本製備區的麵積宜在25m2~30m2之間。本區的壓力梯度要求為:相對於鄰近區域為正壓,以避免從鄰近區進入本區的氣溶膠(jiāo)汙染。
擴增室
該區域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已製備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本製備區)的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和製備區)製(zhì)備成反應混合液等也可(kě)在本區內進行。
在巢式PCR測定中,通常(cháng)在第一輪擴增後必須打開反應管,因此巢式擴增有較高的汙染危險性,第二次加樣必須在本區內進行。
擴增室主要配備PCR實驗室的核心儀器PCR儀,本文實例中使用了ABI7500和ABI9700兩種PCR儀。
在實驗室建造過程中,需要給PCR儀配備專門的UPS電源,以保證其正常工作。該區麵積控製在15m2~20m2。
本區的壓力梯(tī)度要求為:相對於鄰近區域(yù)為負壓,以避免氣溶膠從本區漏出(chū)。為避免氣溶膠所(suǒ)致的汙染,應盡量(liàng)減少在本區內的(de)不必(bì)要的走動。個別操作如加樣等應在超(chāo)淨(jìng)台內進行。建議采用5~10Pa壓差,在控製上(shàng)比較(jiào)容易實現。
產物分析區
該區域主要(yào)進行的操作(zuò)為擴增片段的測定(dìng)。如使用全自(zì)動封閉分析儀器檢測,此區域可不設。
在室內配(pèi)備通風櫥,保證房間內的相對負壓,空氣從室外流向室內。該區麵積控製在15m²~20m²。
本區是最主要的擴增產物汙染來源,因此(cǐ)對本區的(de)壓力梯(tī)度的要求為:相對於鄰近區域為負壓,以避免擴增產物從本區擴散至其它區域。建議采用5~10Pa壓差,在控製上比較容易實現。
03
正負(fù)壓區域緩衝(chōng)室的設置
根據壓力梯度的要求,試劑配製室和樣品處理室為相對正壓,擴增室和產(chǎn)物(wù)分析室為相對(duì)負壓,要求正壓的區域和要(yào)求負壓的區域的緩衝室內的(de)壓(yā)力設計大不相(xiàng)同。
正壓緩衝室(shì)符合(hé)一般(bān)正壓潔(jié)淨室的(de)緩衝原則,主(zhǔ)要(yào)是防止室外環境空氣中的氣溶膠進入室內。正壓緩衝室的布置(zhì)如圖(tú)2所示。
圖表2、正壓緩衝室的布置圖
負壓緩衝室(shì)則是要(yào)求緩衝室對核酸擴增室及產物分(fèn)析區保持正壓,對緩衝室外也保持正壓(yā)(主要是滿足室內(nèi)淨化需(xū)要,如室內無(wú)潔淨要求,此處可以為0壓)。負壓緩衝室的布置如圖3所示。
圖表3、負壓緩衝室(shì)的布置圖
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